<p>Great, thanks for your help.<br>
Reggie</p>
<div class="gmail_quote">On Feb 1, 2013 12:06 PM, "Konrad Hinsen" <<a href="mailto:konrad.hinsen@fastmail.net">konrad.hinsen@fastmail.net</a>> wrote:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Reginald Smith writes:<br>
<br>
 > Ok, sorry I was trying to find out if MMTK could calculate the<br>
 > approximate minimum free energy profile ab initio from a<br>
 > sequence. Is there a way to do this with MMTK or should I try<br>
 > another tool?<br>
<br>
MMTK doesn't generate structure, so you need some other tool for that.<br>
In the rare cases I need to generate ab-initio structures, I use PyMol<br>
and then load the PDB file from PyMol into MMTK.<br>
<br>
Konrad<br>
</blockquote></div>