<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Dec 6, 2012 at 2:35 AM, Konrad Hinsen <span dir="ltr"><<a href="mailto:research@khinsen.fastmail.net" target="_blank">research@khinsen.fastmail.net</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div class="im">Jinrui Xu writes:<br>
<br>
 > New problems about installation appear when I call " from MMTK.Dynamics import<br>
 > VelocityVerletIntegrator, Heater". The error message is listed below. The key line is<br>
 > "MMTK.Utility.MMTKError: Trajectories are not available because the netCDF module is<br>
 > missing."<br>
 > I simply installed netcdf-4.1.3. by such commands:  ./configure --enable-shared<br>
 > --disable-netcdf-4; make check install; and there was no error reported.<br>
<br>
</div>The Python interface to netCDF is provided by ScientificPython, so you<br>
need to install ScientificPython *after* installing netCDF. Moreover,<br>
if netCDF is installed in a non-standard location (neither /usr nor<br>
/usr/local), then you will have to tell ScientificPython the path to<br>
the installation directory.<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
Konrad.<br>
--<br>
---------------------------------------------------------------------<br>
Konrad Hinsen<br>
Centre de Biophysique Moléculaire, CNRS Orléans<br>
Synchrotron Soleil - Division Expériences<br>
Saint Aubin - BP 48<br>
91192 Gif sur Yvette Cedex, France<br>
Tel. <a href="tel:%2B33-1%2069%2035%2097%2015" value="+33169359715">+33-1 69 35 97 15</a><br>
E-Mail: research AT khinsen DOT fastmail DOT net<br>
<a href="http://dirac.cnrs-orleans.fr/~hinsen/" target="_blank">http://dirac.cnrs-orleans.fr/~hinsen/</a><br>
---------------------------------------------------------------------<br>
</font></span></blockquote></div>Hi Konrad,<div><br></div><div>Thanks for your clue! I solve the problem by setting the path of /usr/local/lib/libnetcdf.so.7 in my .bashrc. Not sure what cause the missing of the path. </div>
<div><br></div><div>Jinrui,</div>