Hi Edvin,<br>You can convert a modes object into a numpy array with:<br>numpy.asarray(modes)<br>And then save, pickle or whatever as a numpy array. Other modules, such as MDAnalysis can use numpy arrays to write gromacs vectors, for example.<br>
See also some previous posts (by me) about the difference between numpy.asarray(modes) and modes.array.<br>Cheers,<br>Ramon<br><br><br><div class="gmail_quote">2011/10/4 Edvin Fuglebakk <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:edvin.fuglebakk@ii.uib.no">edvin.fuglebakk@ii.uib.no</a>&gt;</span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;"><div style="word-wrap:break-word">Dear MMTK mailing list. <div><br></div><div>I would like to communicate serialized normal modes (calculated with MMTK) between computational environments, with possibly different versions of python and MMTK. Is there are recommended way for doing this. The MMTK.save and MMTK.load function seems to be sensitive to the python / MMTK configuration.</div>
<div><br></div><div>regards</div><br><div>
<span style="border-collapse:separate;color:rgb(0, 0, 0);font-family:Helvetica;font-style:normal;font-variant:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:-webkit-auto;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;font-size:medium"><span style="border-collapse:separate;color:rgb(0, 0, 0);font-family:Helvetica;font-style:normal;font-variant:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:-webkit-auto;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;font-size:medium"><div style="word-wrap:break-word">
<div>Edvin Fuglebakk</div><div>Ph.D. student</div><div><br></div><div>Department of Informatics</div><div>University of Bergen (UiB)</div><div><br></div><div><a href="mailto:edvin.fuglebakk@ii.uib.no" target="_blank">edvin.fuglebakk@ii.uib.no</a></div>
</div></span><br></span><br>
</div>
<br></div><br>_______________________________________________<br>
mmtk maillist  -  <a href="mailto:mmtk@starship.python.net">mmtk@starship.python.net</a><br>
<a href="http://starship.python.net/mailman/listinfo/mmtk" target="_blank">http://starship.python.net/mailman/listinfo/mmtk</a><br>
<br></blockquote></div><br>