<html><head><style type="text/css"><!-- DIV {margin:0px;} --></style></head><body><div style="font-family:times new roman,new york,times,serif;font-size:12pt"><div>Dear all,<br>&nbsp; I'm a fresh hand in MMTK and planning to refine a&nbsp; tRNA model which contains the modified nucleotides.<br>&nbsp; The model was generated by ModeRNA.<br>&nbsp; MMTK discarded the&nbsp; the modified nucleotides during refinement.<br>&nbsp;Although I got the parameter files for&nbsp;  the modified nucleotides in Amber format, I read though the manual and<br>&nbsp; had no idea how to use and where to put the parameter files in MMTK.<br><br>Would you please give any suggestions?<br><br>Thanks in advance!<br><br>Best<br>Dong<br></div>
</div><br>





      &nbsp;</body></html>