Dear nMoldyn users,<br><br>Does anyone have a rough estimate of nMoldyn computing time to calculate the incoherent intermediate structure factor? I am using the default settings:<br><br><i>Q: 0.:2.:100.<br>Q shell width: 1.<br>
Vectors per shell: 50<br>Window width for FFT: 10% of trajectory length<br>Time step in output: 2000<br>Points in spectrum: 2000</i><br><br>My system is composed of about 2600 atoms (800 of them are deuterium) and I have 50,000 frames (0.02ps between consecutive frames). <br>
<br>I have never ran it before, so I&#39;d like to know how much I am supposed to wait before assuming something is wrong :)<br clear="all"><br>Regards,<br>-- <br>Jose M. Borreguero<br>Postdoctoral Associate<br>Oak Ridge National Laboratory<br>
P.O. Box 2008, M.S. 6164<br>Oak Ridge, TN 37831<br>phone: 865-241-3071 fax: 865-576-5491<br>Email: <a href="mailto:borreguerojm@ornl.gov">borreguerojm@ornl.gov</a><br>