<html><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Hi, thanks to Konrad we solved the crash related to Numerical Phyton version. &nbsp;<div>&nbsp;<div>But the error with xNmoldin is still there.</div><div>We have check the installation of the various libnetcdf* &nbsp;in&nbsp;&nbsp;/usr/lib (also usr/local/lib) and they seem ok.</div><div>Is there a way to verify that MMTK and netCDF do actually interact?</div><div><br></div><div><br><div apple-content-edited="true"> <span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; border-spacing: 0px 0px; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; text-align: auto; -khtml-text-decorations-in-effect: none; text-indent: 0px; -apple-text-size-adjust: auto; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -khtml-nbsp-mode: space; -khtml-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; border-spacing: 0px 0px; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; text-align: auto; -khtml-text-decorations-in-effect: none; text-indent: 0px; -apple-text-size-adjust: auto; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; "><br class="Apple-interchange-newline"><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><p style="margin: 0.0px 0.0px 1.0px 67.0px; text-indent: -67.0px; font: 14.0px Helvetica"><b><span class="Apple-style-span" style="font-weight: normal; ">root@papa001169 nMOLDYN-2.2.5]# xMoldyn<br>Traceback (most recent call last):<br>&nbsp;File "/usr/bin/xMoldyn", line 10, in &lt;module><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;from nMoldyn.misc import getData, getTypes, getAtoms, saveText, getResidues,\<br>&nbsp;File "/usr/lib/python2.5/site-packages/nMoldyn/misc.py", line 2, in &lt;module><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;from calc import qVectorGenerator, qTrajectory, Quidam<br>&nbsp;File "/usr/lib/python2.5/site-packages/nMoldyn/calc.py", line 4, in &lt;module><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;from MMTK.Trajectory import Trajectory<br>&nbsp;File "/usr/lib64/python2.5/site-packages/MMTK/Trajectory.py", line 17, in &lt;module><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;"because the netCDF module is missing.")<br>MMTK.Utility.MMTKError: Trajectories are not available because the netCDF module is missing.<br></span></b></p></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px;"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">-------------------------------------------------------</span></span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px;"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">&nbsp; &nbsp;&nbsp;Prof. Ulderico Wanderlingh</span></span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px;"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">Dipt. di Fisica, UniversitÓ di Messina</span></span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px;"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">Salita Papardo, vill. S.Agata 98166 Messina</span></span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px;"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">tel: +39 0906765023 - fax: +39 090395004</span></span></font></div><div><div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px;"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">homepage <a href="http://ww2.unime.it/wanderlink">http://ww2.unime.it/wanderlink</a></span></span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div></div></div></span></div><br class="Apple-interchange-newline"></span> </div><br></div></div></body></html>