<html><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div>&nbsp;hello,&nbsp;</div><div>we have tried to install Nmoldin, which rely on MMTK, on a AMD64 with Fedora7.</div><div>When xNmoldyn &nbsp;is launched we get that&nbsp;horrible&nbsp; output shown at the bottom.</div><div>The netcdf lib are were installe in /usr/lib as requested, and all the necessary packages were installed by source. Does anyone have suggestion??</div><div><br></div><div>many thanks Ulderico e Valeria</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div>[Valeria@papa001169 ~]$ xMoldyn</div><div>Traceback (most recent call last):</div><div>&nbsp;&nbsp;File "/usr/bin/xMoldyn", line 10, in &lt;module></div><div>&nbsp;&nbsp; &nbsp;from nMoldyn.misc import getData, getTypes, getAtoms, saveText, getResidues,\</div><div>&nbsp;&nbsp;File "/usr/lib/python2.5/site-packages/nMoldyn/misc.py", line 2, in &lt;module></div><div>&nbsp;&nbsp; &nbsp;from calc import qVectorGenerator, qTrajectory, Quidam</div><div>&nbsp;&nbsp;File "/usr/lib/python2.5/site-packages/nMoldyn/calc.py", line 4, in &lt;module></div><div>&nbsp;&nbsp; &nbsp;from MMTK.Trajectory import Trajectory</div><div>&nbsp;&nbsp;File "/usr/lib64/python2.5/site-packages/MMTK/Trajectory.py", line 17, in &lt;module></div><div>&nbsp;&nbsp; &nbsp;"because the netCDF module is missing.")</div><div>MMTK.Utility.MMTKError: Trajectories are not available because the netCDF module is missing.</div><div>*** glibc detected *** /usr/bin/python: double free or corruption (out): 0x00002aaaaaaf64e0 ***</div><div>======= Backtrace: =========</div><div>/lib64/libc.so.6[0x3633670412]</div><div>/lib64/libc.so.6(cfree+0x8c)[0x3633673b1c]</div><div>/usr/lib64/python2.5/site-packages/Numeric/RNG/RNG.so[0x2aaab176303e]</div><div>/usr/lib64/libpython2.5.so.1.0[0x3f070679c7]</div><div>/usr/lib64/libpython2.5.so.1.0(PyDict_SetItem+0x98)[0x3f07069628]</div><div>/usr/lib64/libpython2.5.so.1.0(_PyModule_Clear+0xbc)[0x3f0706b6ac]</div><div>/usr/lib64/libpython2.5.so.1.0(PyImport_Cleanup+0x4b9)[0x3f070c9519]</div><div>/usr/lib64/libpython2.5.so.1.0(Py_Finalize+0xbc)[0x3f070d089c]</div><div>/usr/lib64/libpython2.5.so.1.0(Py_Main+0x4c4)[0x3f070d9f94]</div><div>/lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf4)[0x363361daa4]</div><div>/usr/bin/python[0x400629]</div><div>======= Memory map: ========</div><div>00400000-00401000 r-xp 00000000 fd:00 9932207 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;/usr/bin/python</div><div>00600000-00601000 rw-p 00000000 fd:00 9932207 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;/usr/bin/python</div><div>00601000-00b8a000 rw-p 00601000 00:00 0 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;[heap]</div><div>40000000-40001000 ---p 40000000 00:00 0</div><div>40001000-40a01000 rw-p 40001000 00:00 0</div><div>3632600000-363261a000 r-xp 00000000 fd:00 23035913 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/ld-2.6.so</div><div>3632819000-363281a000 r--p 00019000 fd:00 23035913 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/ld-2.6.so</div><div>363281a000-363281b000 rw-p 0001a000 fd:00 23035913 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/ld-2.6.so</div><div>3632e00000-3632e02000 r-xp 00000000 fd:00 23035937 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libutil-2.6.so</div><div>3632e02000-3633001000 ---p 00002000 fd:00 23035937 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libutil-2.6.so</div><div>3633001000-3633002000 r--p 00001000 fd:00 23035937 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libutil-2.6.so</div><div>3633002000-3633003000 rw-p 00002000 fd:00 23035937 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libutil-2.6.so</div><div>3633600000-3633747000 r-xp 00000000 fd:00 23035917 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libc-2.6.so</div><div>3633747000-3633946000 ---p 00147000 fd:00 23035917 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libc-2.6.so</div><div>3633946000-363394a000 r--p 00146000 fd:00 23035917 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libc-2.6.so</div><div>363394a000-363394b000 rw-p 0014a000 fd:00 23035917 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libc-2.6.so</div><div>363394b000-3633950000 rw-p 363394b000 00:00 0</div><div>3633a00000-3633a82000 r-xp 00000000 fd:00 23035927 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libm-2.6.so</div><div>3633a82000-3633c81000 ---p 00082000 fd:00 23035927 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libm-2.6.so</div><div>3633c81000-3633c82000 r--p 00081000 fd:00 23035927 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libm-2.6.so</div><div>3633c82000-3633c83000 rw-p 00082000 fd:00 23035927 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libm-2.6.so</div><div>3633e00000-3633e02000 r-xp 00000000 fd:00 23035930 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libdl-2.6.so</div><div>3633e02000-3634002000 ---p 00002000 fd:00 23035930 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libdl-2.6.so</div><div>3634002000-3634003000 r--p 00002000 fd:00 23035930 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libdl-2.6.so</div><div>3634003000-3634004000 rw-p 00003000 fd:00 23035930 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libdl-2.6.so</div><div>3634200000-3634214000 r-xp 00000000 fd:00 23035929 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libz.so.1.2.3</div><div>3634214000-3634413000 ---p 00014000 fd:00 23035929 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libz.so.1.2.3</div><div>3634413000-3634414000 rw-p 00013000 fd:00 23035929 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; /lib64/libz.so.1.2.3</div><div>3634600000-3634605000 r-xp 00000000 fd:00 9931328 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;/usr/lib64/libXdmcp.so.6.0.0</div><div>3634605000-3634804000 ---p 00005000 fd:00 9931328 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;/usr/lib64/libXdmcp.so.6.0.0</div><div>3634804000-3634805000 rw-p 00004000 fd:00 9931328 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;/usr/lib64/libXdmcp.so.6.0.0</div><div>3634a00000-3634a02000 r-xp 00000000 fd:00 9929955 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;/usr/lib64/libXau.so.6.0.0</div><div>3634a02000-3634c01000 ---p 00002000 fd:00 9929955 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;/usr/lib64/libXau.so.6.0.0</div><div>3634c01000-3634c02000 rw-p 00001000 fd:00 9929955 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;/usr/lib64/libXau.so.6.0.0</div><div>3634e00000-3634f04000 r-xp 00000000 fd:00 9931329 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;/usr/lib64/libX11.so.6.2.0</div><div>3634f04000-3635104000 ---p 00104000 fd:00 9931329 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;/usr/lib64/libX11.so.6.2.0</div><div>3635104000-363510b000 rw-p 00104000 fd:00 9931329 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Aborted</div><div>[Valeria@papa001169 ~]$ &nbsp; &nbsp;</div><div apple-content-edited="true"> <span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; border-spacing: 0px 0px; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; text-align: auto; -khtml-text-decorations-in-effect: none; text-indent: 0px; -apple-text-size-adjust: auto; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -khtml-nbsp-mode: space; -khtml-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; border-spacing: 0px 0px; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; text-align: auto; -khtml-text-decorations-in-effect: none; text-indent: 0px; -apple-text-size-adjust: auto; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; "><br class="Apple-interchange-newline"><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px;"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">-------------------------------------------------------</span></span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px;"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">&nbsp; &nbsp;&nbsp;Prof. Ulderico Wanderlingh</span></span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px;"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">Dipt. di Fisica, UniversitÓ di Messina</span></span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px;"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">Salita Papardo, vill. S.Agata 98166 Messina</span></span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px;"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">tel: +39 0906765023 - fax: +39 090395004</span></span></font></div><div><div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" size="3"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px;"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">homepage <a href="http://ww2.unime.it/wanderlink">http://ww2.unime.it/wanderlink</a></span></span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ; font-size: 12px; "><br class="khtml-block-placeholder"></div></div></div></span></div><br class="Apple-interchange-newline"></span> </div><br></body></html>