[MMTK] Rotating parts of the side-chain of a residue

Urban Hafner ujh at gmx.com
Sun Jan 25 15:26:04 CET 2004


On Sunday, Jan 25, 2004, at 15:12 Europe/Berlin, Konrad Hinsen wrote:

>> Another question: Is this code "sidechain.CG" etc legal? Or what is 
>> the
>> best way to get specific atoms by name from a residue?
>>
> This is the best way, after setting "sidechain" to the sidechain group 
> of the residue, of course.
>
> The names of atoms and groups are defined in the MMTK database 
> (MMTK/Database/Groups/*) and can be used freely in applications.

If I look into the database it look like the atoms are named C_gamma 
and such
instead of CG. Do they both work?

Urban
--
26. Lunyu 15.34 (Kapitel Wei Ling Gong)
   Der Meister sprach: "Den Edlen kann man nicht an seinen kleinen
   Fertigkeiten erkennen, aber man kann ihn mit grossen Aufgaben
   betrauen. Den Gemeinen kann man nicht mit grossen Aufgaben
   betrauen, dafuer kann man ihn aber in seinen kleinen Fertigkeiten
   schaetzen lernen."




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